东阿阿胶拥有业内唯一的国家胶类中药工程技术研究中心，是国家胶类中药标准制定者、国家综合性新药研发技术大平台产业化示范企业，拥有院士工作站、博士后科研工作站、泰山学者岗位;拥有345项专利，参与了胶类中药的标准研究，其中有37项已纳入国家标准。制定了严于国家标准的内控标准，检测指标比国家药典规定的指标多出122项。
在提取自控技术应用方面，阿胶炼胶自控技术可以对阿胶炼制生产全过程842个控制点的工艺参数进行控制;复方阿胶浆提取自控技术则实现了提取全过程的967个控制点的智能控制。
东阿阿胶通过智能制造的实施，全面提升装备技术水平，引领了整个阿胶行业的发展。目前，东阿阿胶已实现了工厂自控率90%，生产效率提高40%，综合能源利用率提高1倍，每年节约生产成本300万元以上，大大地解放了劳动力。
同时，东阿阿胶采用全产业链质量管控，用先进的RFID溯源系统和严于国家标准的内控标准，从上游养殖、疾控、饲养、运输、交易、深加工，到中游的制造、检测，再到下游的销售、服务，掌控和追溯一头驴从出生到转化为阿胶再到消费者手中的全过程。
