患者通过在病甲外部涂抹药物的方法
这类治疗方法往往直接有效，但中医药物的渗透力一般，往往需要先用利器刮除病甲后才能开展治疗，患者痛苦不堪;而西医药物虽然有强力渗透剂的帮助渗透能力强，但是药物成分本身仍然以抗生素为主，对人体的副作用难以避免。所以传统的外敷治疗脚灰指甲的治疗方法虽然简单有效但是同样让人觉得有十分遗憾的地方。
中医古方治疗脚灰指甲的治疗方法
其主要原理和治疗过程均与外敷治疗法的原理和治疗过程相似，只是中医的外用药物被替换成一些在“民间传说”中具有杀菌功效的植物或药物。这类偏方的可信度差，而且很多偏方本身的来源就值得考究，临床上也常见因为误信偏方耽误治疗导致严重后果的案例。因此，虽然很多偏方被传说的神乎其神，但很少有患者愿意以身试药。
外科手术的方式拔除病甲的脚灰指甲
由于脚灰指甲的病发处就是人体坐立行走的功能器官脚趾，所以手术治疗法必然会因为去除患者的脚灰指甲导致影响患者的正常生活。况且，这种质量方法创面大，出血多，患者在术后处理不当引起伤口感染的可能性高，而且更重要的是，患者既无法依靠手术治疗根除灰指甲的病发，又无法长期依靠此法治疗脚灰指甲，所以这类治疗办法只能“救急”却不能“医病”。
服用抗真菌类药物抑制病原真菌发作
由于脚灰指甲的患处位于脚趾的顶端，因此这类疗法虽有一定的疗效，但是服药的周期往往较长，且长期口服杀菌类抗生素药的副作用也很巨大，患者常常还没有治愈灰指甲就已经因为肝肾功能受刺激而不得不放弃治疗了，况且此法也无法解决停药后脚灰指甲复发的问题。这类治疗方法也是只治标不治本，弊大于利。
